尽管吸入皮质类固醇治疗，但人类遗传学影响哮喘发作的微生物组组成
2023/08/23
摘要
背景：尽管吸入糖皮质激素(ICS)治疗，上气道微生物组仍参与哮喘发作。虽然人类遗传调节微生物组的组成，但其对哮喘相关气道细菌的影响尚不清楚。
目的：我们的目的是鉴定与哮喘急性发作和ICS反应相关的气道微生物组特征的基因和生物通路。
方法：对257例欧洲哮喘患者的唾液、鼻和咽部样本进行分析。我们通过微生物组全基因组关联研究检验了6,296,951个遗传变异与ICS治疗后加重相关的微生物组特征之间的关联。在基因集富集分析中检测1x10-4<p<1x10-6的变异体。在114名患和未患哮喘的非洲裔美国儿童和158名拉丁美洲儿童中，我们寻找可复制的显著结果。将文献中报道的与ICS应答相关的SNPs作为微生物组数量性状位点(mbQTLs)进行评估。多重比较通过错误发现率(FDR)进行校正。要了解详细的方法，请参见本文在线存储库中的方法部分:www.jacionline.org。
结果：与哮喘加重相关的气道微生物组特征相关的基因在哮喘共病易感性(即反流性食管炎、肥胖和吸烟)中富集，并可能受曲古抑菌素A和NF-κB、NR3C1和CEBP转录因子(7.8x10-13≤FDR≤0.022)的调控。吸烟，曲古抑菌素A, NF-κB和NR3C1的富集在不同人群的唾液样本中重复(4.42x10-9≤p≤0.008)。ICS反应相关SNPs rs5995653 (APOBEC3B APOBEC3C)、rs6467778 (TRIM24)和rs5752429 (TPST2)被鉴定为上呼吸道链球菌、坦纳菌和弯曲杆菌的MB QTL(0.027≤FDR≤0.050)。
结论：哮喘急性发作相关菌群特征相关基因可能影响哮喘共病。我们加强了曲古抑菌素A、NF-κB、NR3C1和CEBP在哮喘发作中的治疗作用。
文献来源：Javier Perez-Garcia, et al. Human Genetics Influences Microbiome Composition Involved in Asthma Exacerbations despite Inhaled Corticosteroid Treatment.JACI. 2023 Jun.8 PMID: 37301411
背景：尽管吸入糖皮质激素(ICS)治疗，上气道微生物组仍参与哮喘发作。虽然人类遗传调节微生物组的组成，但其对哮喘相关气道细菌的影响尚不清楚。
目的：我们的目的是鉴定与哮喘急性发作和ICS反应相关的气道微生物组特征的基因和生物通路。
方法：对257例欧洲哮喘患者的唾液、鼻和咽部样本进行分析。我们通过微生物组全基因组关联研究检验了6,296,951个遗传变异与ICS治疗后加重相关的微生物组特征之间的关联。在基因集富集分析中检测1x10-4<p<1x10-6的变异体。在114名患和未患哮喘的非洲裔美国儿童和158名拉丁美洲儿童中，我们寻找可复制的显著结果。将文献中报道的与ICS应答相关的SNPs作为微生物组数量性状位点(mbQTLs)进行评估。多重比较通过错误发现率(FDR)进行校正。要了解详细的方法，请参见本文在线存储库中的方法部分:www.jacionline.org。
结果：与哮喘加重相关的气道微生物组特征相关的基因在哮喘共病易感性(即反流性食管炎、肥胖和吸烟)中富集，并可能受曲古抑菌素A和NF-κB、NR3C1和CEBP转录因子(7.8x10-13≤FDR≤0.022)的调控。吸烟，曲古抑菌素A, NF-κB和NR3C1的富集在不同人群的唾液样本中重复(4.42x10-9≤p≤0.008)。ICS反应相关SNPs rs5995653 (APOBEC3B APOBEC3C)、rs6467778 (TRIM24)和rs5752429 (TPST2)被鉴定为上呼吸道链球菌、坦纳菌和弯曲杆菌的MB QTL(0.027≤FDR≤0.050)。
结论：哮喘急性发作相关菌群特征相关基因可能影响哮喘共病。我们加强了曲古抑菌素A、NF-κB、NR3C1和CEBP在哮喘发作中的治疗作用。
文献来源：Javier Perez-Garcia, et al. Human Genetics Influences Microbiome Composition Involved in Asthma Exacerbations despite Inhaled Corticosteroid Treatment.JACI. 2023 Jun.8 PMID: 37301411
（中国医科大学附属第一医院呼吸与危重症医学科 高与遥 孔灵菲）
