用于哮喘microRNA生物标志物鉴定的基因网络分析
2023/02/09
摘要
背景：迄今为止，哮喘的可靠生物标志物还没有被发现。MicroRNAs (miRNAs)是一种小的非编码RNA，可负向调节转录后基因表达，它们与包括哮喘在内的多种疾病有关。MiRNAs可以作为理想的生物标志物，因为它们能够调节多种途径。本研究旨在识别哮喘的miRNA生物标志物特征。
方法：采用屋尘螨(HDM)小鼠过敏性炎症模型。通过评估肺功能、过敏反应、气道炎症和重塑对小鼠进行表型分析。通过小RNA测序确定血清和肺组织中的miRNA特征谱，并使用Qiagen CLC Genomics Workbench对数据进行分析。为了确定相关的基因靶点，我们进行了mRNA测序，然后进行mirna -靶点分析。这些miRNAs和靶标有待于后续的通路和功能分析。
结果：HDM暴露的小鼠出现了过敏性哮喘的表型特征。miRNA测序分析显示，与对照组小鼠相比，213个miRNAs在HDM小鼠肺中显著失调(FDR p-值< 0.05和倍数变化表达> + 1.5和< - 1.5)。相反，只有一个miRNA (miR-146b-5p)在血清中显著升高。肺调节异常miRNAs的靶分析显示，共131个miRNAs作用于211个mRNAs。通路分析显示，Th2/Th1是与miRNAs失调相关的最显著激活的信号通路。富集度最高的疾病是炎症反应和疾病，其中包括哮喘。哮喘网络分析表明，131个miRNAs中有113个与哮喘发病机制直接相关。
结论：这些发现表明，HDM模型中大多数失调的miRNAs通过Th2信号通路与哮喘发病机制相关。我们确定了一组30种miRNAs作为哮喘的潜在候选生物标志物。
文献来源：Paulene Cay et al. Gene network analysis for identification of microRNA biomarkers for asthma. Respir Res. 2022 Dec 26. ID: 36572876
背景：迄今为止，哮喘的可靠生物标志物还没有被发现。MicroRNAs (miRNAs)是一种小的非编码RNA，可负向调节转录后基因表达，它们与包括哮喘在内的多种疾病有关。MiRNAs可以作为理想的生物标志物，因为它们能够调节多种途径。本研究旨在识别哮喘的miRNA生物标志物特征。
方法：采用屋尘螨(HDM)小鼠过敏性炎症模型。通过评估肺功能、过敏反应、气道炎症和重塑对小鼠进行表型分析。通过小RNA测序确定血清和肺组织中的miRNA特征谱，并使用Qiagen CLC Genomics Workbench对数据进行分析。为了确定相关的基因靶点，我们进行了mRNA测序，然后进行mirna -靶点分析。这些miRNAs和靶标有待于后续的通路和功能分析。
结果：HDM暴露的小鼠出现了过敏性哮喘的表型特征。miRNA测序分析显示，与对照组小鼠相比，213个miRNAs在HDM小鼠肺中显著失调(FDR p-值< 0.05和倍数变化表达> + 1.5和< - 1.5)。相反，只有一个miRNA (miR-146b-5p)在血清中显著升高。肺调节异常miRNAs的靶分析显示，共131个miRNAs作用于211个mRNAs。通路分析显示，Th2/Th1是与miRNAs失调相关的最显著激活的信号通路。富集度最高的疾病是炎症反应和疾病，其中包括哮喘。哮喘网络分析表明，131个miRNAs中有113个与哮喘发病机制直接相关。
结论：这些发现表明，HDM模型中大多数失调的miRNAs通过Th2信号通路与哮喘发病机制相关。我们确定了一组30种miRNAs作为哮喘的潜在候选生物标志物。
文献来源：Paulene Cay et al. Gene network analysis for identification of microRNA biomarkers for asthma. Respir Res. 2022 Dec 26. ID: 36572876
（中国医科大学第一医院呼吸与危重症医学科 高与遥 孔灵菲）
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